Far Cry 3 является шутером от первого лица с открытым миром. Действие игры происходит на тропическом острове где-то на пересечении Индийского и Тихого океанов. Главная цель игры: сбежать с острова и его сумасшедших жителей.

Игроку предстоит взять на себя роль протагониста Джейсона Броди, туриста, отправившегося с друзьями провести отпуск на экзотическом острове. По прибытии на остров выясняется, что он оккупирован бандитами. Большая часть друзей Джейсона погибает, а яхта, на которой они приплыли - взорвана.

Джейсон выживает и ему необходимо добраться до своей подруги. В её поисках, он будет иметь дело с широкой подборкой персонажей - преимущественно неадекватных психов и наркоманов, оказавшихся в ловушке на этом острове. Один из ключевых лиц Far Cry 3 станет Ваас Монтенегро. Антагонист, который кажется сумасшедшим рассказывая о природе безумия, при этом пытаясь убить героя.

В Far Cry 3 представлена ролевая система включающая в себя: очки опыта, древо умений и систему крафтинга Игрок может использовать стелс-механику чтобы совершать тихие убийства прыгая на противников сверху или подкрадываясь сзади. Также ему даётся возможность комбинирования скрытого и агрессивного прохождений.

В игровом мире будет встречаться множество различных экзотических животных.